1997年3月20日中研社區組成的「四分溪合唱團」於本教會成立,每週四中午一時30分到三時30分練唱。「中研之聲合唱團」於7月5日假本教會成立,利用周六晚間七時到八時30分練習(10月份起改為周二晚間)。4月6日召開臨時會員大會,舉行陳重光牧師續聘監選,中會派溫宏欣牧師及高李麗珍長老前來主持。任期六年(1997年~2003年)。
1997年10月20日租得研究院路二段12巷57弄8號1樓為牧師館,10月30日陳重光牧師全家搬入牧師館。11月23日成立南福教會少年團契,會長蕭泓﹑副會長兼服務陳子莘﹑靈修兼司庫劉慕晨﹑康樂盧昶維﹑輔導為孫敬全。
1998年1月5日晚間成立「南福教會社青團契」,選出會長沈裕盛﹑副會長陳秀如﹑書記許佳玫﹑會計黃淑蕙﹑顧問劉堅望長老﹑陳明富執事。1月18日定期會員大會中通過更改本教會名稱成為「中研教會」。行文七星中會報備,經七星中會台基長47星委字第016號函:自3月1日起,正式宣佈更改本教會名稱為「中研教會」。
2000年1月1日起,為著增加會友間的彼此關懷,婦女團契將全教會的信徒分成三輛「關懷列車」:信心號列車、榮光號列車及愛心號列車。每輛列車皆設有列車長與駕駛員,負責關懷各輛列車內的乘客。12月7日牧師館遷移至研究院路二段34巷1號3樓。
2001年的目標訂為:研讀「靈命日糧」,由牧師代為索取「靈命日糧」小冊子,至少每戶一本;加強推行此運動。為推廣社區的福音工作,自2001年起,將傳統的主日學轉型為「快樂週末型」,時間改為星期六下午四點到六點,每三個月為一期。
2003年4月27日中會派王南傑牧師與謝慶和長老前來主持小會,討論陳重光牧師續聘事宜,會中陳重光牧師自動請辭。6月1日中會派林榮任牧師兼任本堂小會議長。7月17日中會再派林榮任牧師與黃聖德長老為監交委員,順利完成本堂小會與陳重光牧師的離職交接。
2004年8月1日中會任命魏敏男傳道就任本堂牧會,由小會議長林榮任牧師主持就任儀式。9月20日許忠政長老,陳素貞長老,鄭綉梅執事,董其發執事就任。
2005年2月20日定期和會,補選二名執事。3月20日黃聖奇執事,廖淑姬執事就任。
2006年3月20日~31日修建禮拜堂:堂內衛浴化妝間拆除,移到後院;堂前整建花台並種植花木美化。更換禮拜堂長座椅12張。